一、成果名称
一种适用于矮缩病毒科和双生病毒科病毒基因组拼接的转录组测序方法
二、成果简介
本技术提供了一种适用于矮缩病毒科和双生病毒科病毒基因组拼接的转录组测序方法。该方法包括感染DNA病毒样品的转录组测序,病毒序列的比对和拼接,病毒基因组序列空白区域填补等三个步骤。本技术的方法不仅可以获得香蕉束顶病毒的全基因组序列,还可以通过该方法拼接其他矮缩病毒或双生病毒全基因组,从而获得病毒全基因组序列。本技术在国内外首次报道了利用转录组高通量测序拼接DNA病毒基因组的方法,填补了国内外该领域的空白。本技术还可以应用于DNA病毒鉴定和检测。利用本技术申请澳大利亚专利一件(专利号2021100990),发表一篇高水平SCI论文(Yu et al., Front Bioeng Biotech. 2020, 8: 832)。
图1. 利用转录组拼接矮缩病毒基因组示意图(A)和香蕉束顶病毒基因组(B)
三、合作意向
合作意向为生物测序公司。
四、研发单位
中国热带农业科学院热带生物技术研究所
五、联系人及联系方式
王永壮:0898-66982612/13322005065
余乃通:18889405459,邮箱:yunaitong@163.com